1950年1月14日，顾祝同飞到国民党军残部另一集中地滇南蒙自，部署将第26军撤回台湾，第8军扩编为第8兵团，以汤尧任司令，留在云南进行游击作战。但15日顾祝同刚刚飞离蒙自，16日蒙自即被第二野战军第4兵团所占，切断了残余国民党军的空中退路。其后，第8军退往石屏，第26军退往个旧。17日，第4兵团占个旧，第26军军长彭佐熙率少数残部退往越南、缅甸。24日，第8军被歼，汤尧及第8军军长曹天戈被俘。3月12日，西南军区调3个军各一部共13个团，自南北两面发起西昌战役，23日占富林、会理，24日占泸定、康定，27日占西昌。胡宗南再度临阵脱逃，与贺国光等于27日飞往海南岛。4月13日，西昌地区的国民党军残部被全歼。
1950年1月，中共中央决定由第18军担任进军西藏的任务。10月6日，第18军发起昌都战役，19日进占昌都，歼灭藏军主力6个代本（团）全部和3个代本一部，另有1个代本起义，基本消灭了藏军主力。11月10日，新华社公布了同西藏地方政府进行和平谈判的10项条件（经中共中央于6月2日批准）。1951年2月中旬，西藏地方政府派出代表团到北京，与中央人民政府代表团进行谈判。5月23日，《中央人民政府和西藏地方政府关于和平解放西藏办法的协议》（共17条）签订，主要内容为：西藏回到祖国大家庭，实行民族区域自治；人民解放军进入西藏，巩固国防；西藏现行政治制度不予变更，各项改革事宜不加强迫，实行宗教自由；达赖与班禅的固有地位与职权不变；中央政府统一处理西藏一切涉外事宜。9月9日，第18军先遣支队进驻拉萨。至此，除台湾及部分沿海岛屿仍在国民党的控制之下，香港和澳门仍分别为英国和葡萄牙所占外，中国领土实现了完全的统一。