然而好景不长，就在陈独秀踌躇满志在《甲寅》杂志不吐不快之时，1915 年春夏之际，接到好友汪孟邹来信，告知高君曼染上肺疾，咯血不止，陈独秀不得不于6月中旬返回上海。
北大执教， 《新青年》大放异彩
这次从日本归来，陈独秀做出一个决定：创办一份爱国进步的《青年杂志》，即后来的《新青年》杂志。陈独秀将家搬到法租界嵩山路吉谊里21号，即与汪孟邹商量办刊事宜。汪孟邹的亚东图书馆此时已承担几本杂志的发行，经费困难，只好与群益书社联系。群益书社创办人陈子沛、陈子寿同意合作，但提出每月一期，只能付200 元编辑费与稿费。
“由于是新刊，不知销路如何，我们只能试着来。”
陈子沛表示，言外之意只能开出这个报酬。汪孟邹知道陈独秀一家四口生活无着，这笔钱虽然不多，但可以养家糊口，何况新办刊物确实风险很大，便与陈独秀商量接受了这个条件。
1915 年9 月15 日，由陈独秀主撰的《青年杂志》创刊号问世。陈独秀在创刊号发刊词《敬告青年》中写道：“国人而欲脱蒙昧时代，羞为浅化之民也，则急起直追，当以科学与人权并重。”首次在中国举起民主与科学之旗帜，成为反封建新文化运动的开端。