那时正值七月天气，流火铄金，疾疫大盛，阳明也就班师奏凯。他又周历山川，详问地方父老，山溪苗酋，开图立里，经理城堡。他并顺着苗地实情，设立土官，牵制苗人头领，又特设流官，分设土官巡检，散开苗瑶部众，务使苗汉交和，公私两便。一时间，阳明选官任用，遣将镇守，忙得神倦心疲，病势加重。
三十二、阳明逝世
嘉靖七年（1528）十二月，阳明五十七岁
阳明巡抚南赣，出入山谷，就曾中着热毒，常常上咳下痢；后来退休越中，延医调治，稍微好些，但终不能断根。上年又奉命入广，益发住在那炎荒烟瘴地方，力疾从公，终致旧病重发。到十月间，渐觉已撑持不下来了。于是，阳明便一面上疏乞归养病，一面决计从梧州直下广东，到韶、雄左右候命，谁知朝廷留中不报。
船路过乌蛮滩，船家指说，上面便是伏波庙，阳明还上去拜谒；待到得增城，一来这里是他老友湛甘泉的故居，二来此地有他五世祖王纲的祀庙，阳明也上去设祭题诗。不料，阳明又因此加重腹泻，疲乏不堪，两脚不能坐立。他还念着许多门人，伏枕草书，去勉励他们；他心里也知病势无望，遂把归田的夙愿，渐渐丢开，只想和他的阳明洞，会过一面，就此长别，也算了却最后私愿。