在创新实践中，直觉思维的作用是巨大的。
第一，帮助我们选择目标。在创新的过程中，人们常常会面临目标的选择，特别是当各种目标在一起，难以区分的时候，我们往往会陷入不知道如何是好的地步。目标的确定，仅仅靠逻辑推理是不行的，有的时候需要借助直觉的力量，敏锐察觉到目标的深远意义，从而产生重大的发明或者发现。英国著名的物理学家卢瑟福凭借直觉的判断，全力地投入到原子物理学和原子核物理学的研究领域，做出了一系统伟大的贡献。
第二，帮助我们提出某些假设。直觉思维能够突破经验思维和理论思维的限制，充分调动思维的潜能，从思维的起点一下子跨越到思维的终点，从而创造性地提出新的科学理论。在20世纪初，物理学家普朗克提出了量子假说，引发了经典物理学的一场革命；爱因斯坦则凭借非凡的直觉思维能力，把这场革命推向了顶峰，出现了物理学界的一系列大发现。
其实我们的潜意识就好像是直觉，在直觉刚刚出现的时候是一股涓涓细流，如果意识活动太强，就会堵塞潜意识的细流；如果任期自然流动，所做的只是在下面用容器接水，那么出水口就会越来越大，流出的水也就会越来越多。