可惜，看似千秋万代的太平盛世并没有持续太久，阿蒙霍特普三世的次子阿蒙霍特普四世发起了大刀阔斧的改革。他不仅废除了从北方尼罗河三角洲到南方努比亚普遍崇拜的隼神荷鲁斯和许多神祇，还废除了自古以来的主神阿蒙（Amun），用独一无二的全能之神阿顿（Aten）取而代之，阿顿即有形的太阳，具体表现为一个球形太阳的图像，它辐射出的光线最终落在伸出的双手之上。
为了巩固这一巨大转变，阿蒙霍特普四世还把自己的名字改为埃赫那顿（Akhenaten，意为“阿顿的什人”或“阿顿的光辉灵魂”），并迁都到新的城市埃赫塔吞[Akhetaten，如今被称为阿玛纳（Amarna）]，新都就建在自底比斯沿尼罗河往下至孟斐斯途中的石灰岩悬崖边。这里的人们供奉阿顿神，也就是太阳圆盘，在露天神庙里膜拜太阳与阳光。而埃赫那顿每天乘着镀金战车，在护卫的簇拥下穿城而过，以此象征太阳每日的往复运行[41]。相形之下，古埃及传统的崇拜形式是对着形同鳄鱼或小鸟的神灵吟唱颂歌，不免显得幼稚了些。埃赫那顿还写下了一首激情澎湃的诗篇《阿顿颂歌》（the Great Hymn to the Aten），这是后人在宫廷高官墓中的铭文里发现的。他在诗中赞颂“唯一的神”阿顿创造了世间万物：