咸丰年间，曾国藩洞悉了清代的政治情况和官场的一些风习利弊，他目睹了当时的民生疾苦与武备弊坏，面对着这种时局造成的政风颓靡，他心急如焚，勇敢地呈上了几道陈时弊的奏疏。其中最具有重要性的，是他上奏的一道《敬陈圣德三端预防流弊疏》，文中直率指出如要转移政治风气、培养有用人才，全在皇帝个人的态度。从这一道奏疏中，我们不但可以看出曾国藩忠君爱国及有胆识的耿直风格，也为他以后的“平乱”事业奠定了基础。
在同治二年，曾国藩抱着“贪劣之吏须严惩”的态度，写下了《特参庐江县知县吴燮和贪劣科派请予革职折》，文中说：“我奉命整顿直隶吏治。我深知直隶地处天子脚下，达官显贵多如牛毛，很多人都有通天的本事，稍有疏忽即会出大问题。种种狡诈贪鄙的行为，确实是超出情理之外，若不从严惩办，凭什么来勉励廉洁、告诫百官呢?应当请示圣旨，将五品衔代理安徽庐江县事候补知县吴燮和立即革职，永不再用，还要下令追回所收亩捐钱米，如数清理上缴，以此来告诫那些营私舞弊、欺骗上司的人。”