在这场战争中所覆灭的隶属于大都督府的明初“三大营”编制几近颠覆。战后，朱祁钰令于谦、石亨等人积极组织军事演习，以团营编制重组军队，加强军队将领与士兵之间的熟练度（此前都是尽量避免双方常驻以免将领异心引发叛乱），他还选定善战者十五万交由于谦、石亨等名将，日夜操以严格的训练，使军令如山无敢不服。此外，朱祁钰大力发展军中火器，三大营专有的火铳成为新设兵营的标配，以此专门针对草原民族的游骑兵。明代宗的军事管制和改革在明代历史上产生了深远的影响，将大明的军事实力提高多个档次。明末对火器几乎未再发展，因此明中期对于火器炮铳等火力的研究几乎达到了明清的巅峰水平。他在位期间，也先率领的瓦剌再未侵犯大明内地，北方百姓重新获得了喘息和发展的机会。此外，他还对西南的民族叛乱分子予以打压，令两广总督镇压贵广地区的起义，巩固中央和地方的政权。