工作三年后，古永锵又考了斯坦福的MBA。本来学业结束后，他仍然要回到贝恩工作，但1994年暑期的时候，古永锵来北京大学参加了一个培训班，认识了富国投资的创办人，便改变了初衷，决定加入富国投资，来北京工作。
在富国干了四年后，古永锵认识了张朝阳。据说，两个人见面是谈给搜狐网投资的事，结果谈了一会儿，古永锵就成了搜狐的第一个高管——高级副总裁兼CFO，那时候搜狐只有100人左右。
在搜狐，刚开始的时候古永锵专注于做融资。主导搜狐上市后，古永锵开始接手运营了，包括企业发展、销售、市场、产品。2001年7月古永锵当上了首席运营官，后来又做了总裁。
2004年底，古永锵跟张朝阳提出了离职的想法，理由是陪妻子去美国读书，自己也放松一下身心。当时外界对此有颇多解读，一种说法是，古永锵加入搜狐时的目标基本都已经达到了，他想找一个创业的环境。另一种说法是，因为古永锵有“功高盖主”之嫌，开始被张朝阳冷藏。还有一种说法是，其他公司要挖古永锵跳槽。