其次是对特殊人口群体的救济。特殊人口群体是由鳏寡孤独者、残疾者和穷困者组成。对鳏寡孤独者，明政府制定有专门的救济政策。洪武五年（1372年）颁诏：孤寡者“官养之，毋失所”[112]。并在京城和地方州县一级普遍设立养济院，专门收养鳏寡孤独者。对执行不力者，明政府还制定了很严的处罚性条令，规定“所有官司应收养而不收养者，杖六十。若应给衣粮而官克减者，以监守自盗论。”[113]这种官办的养老院，在一定程度上减少了鳏寡孤独者的困难，避免一部分人因贫困而可能造成的死亡。
明政府的养济院还收留残疾者。洪武初年，明太祖诏令天下，设置养济院安置孤贫残疾者。[114]另据《典故纪闻》载，成化时，京师街头“多有疲癃残疾之人，扶老携幼，呻吟悲号”，明宪宗下令：“无问老幼男女，有无家及外来者，顺天府尹尽数收入养济院记名，设法养赡，毋令失所。”
明代的养济院也对穷困者实行救助，如天顺元年（1457年）“收养贫民于大兴、宛平二县，每县设养济院一所于顺便寺观，从京仓支米煮饭，日给二餐。器皿、柴薪、蔬菜之属，从府县设法措办。有疾者拨医调治，死者给棺木。”[115]
明政府为了防御和应付可能发生的自然灾害，还设立了常平仓和预备仓。如万历二十九年（1601年），福建有人倡议设常平仓，明神宗诏命予以嘉奖。三十九年（1611年），又命于边镇设常平仓，并且强调常平仓“有裨边镇”[116]。这些防御性的仓储设施，积米谷于米丰之时，而粜粮于灾成之日，对缓解百姓的生活压力、减少百姓的流徙、恢复社会经济起到了积极的作用。[117]